无菌室一般为4 - 5 平方米、高 2.5 米的独立小房间(与外间隔离)，专辟于微生物实验室内，可以用板材和玻璃建造。无菌室外要设一个缓冲间，错开门向，以免气流带进杂菌。无菌室和缓冲间都必须密闭、室内装备的换气设备必须有空气过滤装置。在获得了无菌环境和无菌材料后，只有保持无菌状态，才能对某种特定的已知微生物进行研究。
平时我们使用无菌室，工作人员进入到其中都是要消毒的，所以一定要特别注意好整体上的清洁工作。在日常做实验的过程中，难免会有一定的污染，基础的清洁工作我们还是不能省略的。那么日常要如何来进行基础的清洁工作呢?
每天需要做好基础清洁工作。
每天工作人员都是需要确定好基础的一个清洁工作，因为无菌室使用完成之后，其实室内也是可能会有一定的污染，还有一些基础的培养液等第二天肯定也是会腐坏，所以必须要及时将其更换才行。每天的基础清洁工作，建议还是应该落实到人头，这样每天都能够做好基础的清洁工作，自然无菌室也是不会有太大的问题，实用性还是可以放心好的。
将相应的用具及时处理很关键。
其实无菌室中有一些用具都是不可能长期使用的，有一些洁净度不高的产品，也是需要及时进行更换掉，这样才能够保证比较不错的使用效果，也可以为避免严重的污染。如果是可以继续使用到的一些用具，也是需要进行高温消毒等，具体还是要看实际情况。建议每隔一段时间，就应该对无菌室进行内部的彻底清洁，这样达到的效果也是有所保障的，不用我们太过担心。